青島日報(bào)/觀海新聞8月26日訊 近日,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所陳松林團(tuán)隊(duì)成功研制出我國首款魚類抗病育種基因芯片——“魚芯1號”。“魚芯1號”芯片的研發(fā),填補(bǔ)了我國魚類抗病育種基因芯片的空白,為基因組選擇技術(shù)在牙鲆良種選育中的應(yīng)用提供了技術(shù)支撐。
基因芯片,即單核苷酸多態(tài)性(SNP)微陣列,又名DNA微陣列(DNA array),是將數(shù)萬DNA序列標(biāo)記排列在玻片或特殊硅片上,形成SNP探針陣列。基于核酸分子雜交原理,基因芯片可同時(shí)對大量基因和遺傳信息進(jìn)行快速精準(zhǔn)的檢測和分析,具有通量高、自動(dòng)化程度高、操作簡單、檢測效率高、應(yīng)用范圍廣等優(yōu)點(diǎn)。基因芯片技術(shù)在基因組選擇育種、種質(zhì)資源多樣性分析、親緣關(guān)系鑒定、基因組關(guān)聯(lián)分析、基因定位等方面可發(fā)揮重要作用。
據(jù)介紹,研究團(tuán)隊(duì)在前期完成牙鲆全基因組測序、精細(xì)圖譜繪制以及對1099個(gè)牙鲆個(gè)體全基因組重測序的基礎(chǔ)上,自主設(shè)計(jì)位點(diǎn)篩選策略,整合了抗病相關(guān)基因和相關(guān)SNP位點(diǎn),最終選取在全基因組均勻分布的約50000(50K)個(gè)SNP位點(diǎn)制作基因芯片,保證了基因組育種值估計(jì)的準(zhǔn)確性,并基于其基因分型結(jié)果和牙鲆抗病基因組選擇技術(shù)開展了抗細(xì)菌病良種選育。
目前,我國魚類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)中存在病害頻發(fā)、抗病高產(chǎn)良種匱乏等問題,迫切需要建立高效準(zhǔn)確的抗病基因組育種技術(shù),培育抗病高產(chǎn)優(yōu)良品種。(青島日報(bào)/觀海新聞?dòng)浾?李勛祥)
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